Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms