Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX5P48382 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX5P48382 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX5P48382 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX5P48382 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX5P48382 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX5P48382 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms