Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF4P48230 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF4P48230 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms