Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNT3P45378 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms