Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATA4P43694 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms