Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPD2P43304 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPD2P43304 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GPD2P43304 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPD2P43304 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GPD2P43304 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms