Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms