Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL1P40616 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL1P40616 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL1P40616 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL1P40616 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ARL1P40616 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL1P40616 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL1P40616 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL1P40616 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL1P40616 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL1P40616 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms