Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK1P39086 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK1P39086 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK1P39086 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK1P39086 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK1P39086 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK1P39086 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK1P39086 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK1P39086 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms