Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms