Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJC1P36383 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJC1P36383 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJC1P36383 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJC1P36383 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJC1P36383 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms