Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP214P35658 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP214P35658 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP214P35658 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP214P35658 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP214P35658 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP214P35658 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP214P35658 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP214P35658 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP214P35658 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms