Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms