Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms