Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFC1P35251 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFC1P35251 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFC1P35251 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFC1P35251 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFC1P35251 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFC1P35251 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFC1P35251 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms