Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPA3P35244 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA3P35244 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA3P35244 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA3P35244 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA3P35244 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA3P35244 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA3P35244 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms