Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA4P35212 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA4P35212 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms