Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF4P34130 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF4P34130 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms