Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA9P31269 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms