Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms