Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP1P29466 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP1P29466 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP1P29466 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP1P29466 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP1P29466 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP1P29466 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP1P29466 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP1P29466 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP1P29466 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms