Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC5P28715 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms