Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD1P28340 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD1P28340 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms