Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms