Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4AP27815 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4AP27815 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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