Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPREP23469 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPREP23469 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPREP23469 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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