Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms