Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB6P18564 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB6P18564 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB6P18564 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB6P18564 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB6P18564 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms