Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB4P17483 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms