Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms