Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFAP15692 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms