Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT10P13645 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT10P13645 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT10P13645 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms