Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG2P13521 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG2P13521 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG2P13521 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms