Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL5P13501 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL5P13501 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL5P13501 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms