Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms