Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNAT1P11488 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNAT1P11488 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms