Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms