Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms