Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00869P0C866 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms