Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCAP05165 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCAP05165 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCCAP05165 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCAP05165 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCCAP05165 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCAP05165 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms