Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA4P05014 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms