Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYF2O95926 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYF2O95926 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms