Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL1O95922 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL1O95922 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms