Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPM2O94759 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM2O94759 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms