Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNKO75909 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNKO75909 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCNKO75909 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCNKO75909 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCNKO75909 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNKO75909 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNKO75909 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNKO75909 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms