Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3JO75822 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms