Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms