Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45BO75293 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45BO75293 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45BO75293 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45BO75293 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms