Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIN3BO75182 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms