Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms